经国务院批复，横琴口岸澳方口岸区及相关延伸区旅检区域自3月18日零时起启用并适用澳门特别行政区法律实施管辖，粤澳双方代表于3月18日零时在新横琴口岸旅检大厅举办了移交仪式。新横琴口岸旅检正式开通日期由粤澳两地政府商定。
据了解，澳门莲花口岸整体搬迁至横琴口岸，并实行“合作查验、一次放行”便捷通关模式，是落实粤港澳大湾区发展规划，更好的促进澳门经济适度多元发展的又一体现。新口岸设计年通关量为旅客8000万人次、车辆265万辆次、货运量533万吨，主要涵盖口岸功能区、综合交通枢纽功能区、口岸综合开发区三大功能体系。届时将全面提升口岸通关便利化，促进内地与澳门间人员往来更加便利、要素流动更加快捷、经贸联系更加紧密。
拱北海关将在横琴口岸与澳门方执法单位推行多项创新合作，如实施供澳花卉苗木实施“检疫前推、合作监管”模式，两地共同对认可苗圃的花卉苗木生产过程及质量实施监管，对来自认可苗圃的花卉苗木在珠澳口岸不再实施检疫查验；建设横琴口岸“跨境一站式”信息化监管平台，实现对客车、货车采集信息共享、车辆信息一次采集、各自验放、快速放行。此外，还将开展横琴新区强制性产品认证入境验证监管、优化进出境医药材料监管、探索货物（运输工具）一次机检等多项创新举措，将对深度拓展粤澳合作，提升两地海关监管效能，进一步为“做好珠澳合作开发横琴这篇文章”起到积极的推进作用。
